Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
KLHL4Q9C0H6 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms