Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CEP44Q9C0F1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms