Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIPCQ9C0C6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms