Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
KRTAP4-3Q9BYR4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms