Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABARAPL3Q9BY60 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms