Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RNF17Q9BXT8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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