Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms