Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRIP1Q9BX63 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRIP1Q9BX63 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms