Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CNPPD1Q9BV87 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CNPPD1Q9BV87 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms