Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PAGR1Q9BTK6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms