Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TCF25Q9BQ70 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TCF25Q9BQ70 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms