Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms