Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPAS2Q99743 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPAS2Q99743 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPAS2Q99743 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms