Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIC2Q96JB3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms