Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGAP3Q96FM1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms