Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf54Q8WWF1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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