Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM71DQ8N9W8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms