Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF148Q8N7C7 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms