Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLIP4Q8N3C7 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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CLIP4Q8N3C7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLIP4Q8N3C7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLIP4Q8N3C7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLIP4Q8N3C7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLIP4Q8N3C7 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLIP4Q8N3C7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLIP4Q8N3C7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLIP4Q8N3C7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLIP4Q8N3C7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLIP4Q8N3C7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLIP4Q8N3C7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CLIP4Q8N3C7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CLIP4Q8N3C7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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