Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SKAP1Q86WV1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms