Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RASSF3Q86WH2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASSF3Q86WH2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms