Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KIAA1549LQ6ZVL6 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms