Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
LRIG3Q6UXM1 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms