Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RFWD3Q6PCD5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms