Protein–RNA interactions for Protein: Q6J4K2

SLC8B1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1Q6J4K2 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC8B1Q6J4K2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms