Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ODF2Q5BJF6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ODF2Q5BJF6 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms