Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXD4L6Q3SYB3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD4L6Q3SYB3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms