Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 2,897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHD9Q3L8U1 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms