Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC142Q17RM4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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