Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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PTPRNQ16849 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PTPRNQ16849 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PTPRNQ16849 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTPRNQ16849 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTPRNQ16849 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTPRNQ16849 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTPRNQ16849 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTPRNQ16849 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTPRNQ16849 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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PTPRNQ16849 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRNQ16849 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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