Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms