Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDKN3Q16667 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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