Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SGCBQ16585 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SGCBQ16585 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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