Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CSRP2Q16527 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSRP2Q16527 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSRP2Q16527 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSRP2Q16527 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSRP2Q16527 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSRP2Q16527 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSRP2Q16527 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSRP2Q16527 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CSRP2Q16527 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CSRP2Q16527 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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