Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GABRA6Q16445 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms