Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F4Q16254 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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