Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
USF2Q15853 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
USF2Q15853 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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