Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TWIST1Q15672 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms