Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SS18Q15532 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SS18Q15532 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms