Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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CDSNQ15517 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CDSNQ15517 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CDSNQ15517 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CDSNQ15517 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CDSNQ15517 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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CDSNQ15517 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CDSNQ15517 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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CDSNQ15517 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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CDSNQ15517 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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CDSNQ15517 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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CDSNQ15517 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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