Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SIX1Q15475 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SIX1Q15475 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SIX1Q15475 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SIX1Q15475 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SIX1Q15475 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SIX1Q15475 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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SIX1Q15475 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SIX1Q15475 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SIX1Q15475 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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SIX1Q15475 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SIX1Q15475 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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SIX1Q15475 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIX1Q15475 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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