Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF4Q15306 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF4Q15306 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF4Q15306 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF4Q15306 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IRF4Q15306 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF4Q15306 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IRF4Q15306 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IRF4Q15306 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF4Q15306 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF4Q15306 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF4Q15306 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IRF4Q15306 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IRF4Q15306 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.05■□□□□ 0
IRF4Q15306 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF4Q15306 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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