Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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PDCD1Q15116 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PDCD1Q15116 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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PDCD1Q15116 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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PDCD1Q15116 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PDCD1Q15116 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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