Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCLAFQ15004 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCLAFQ15004 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms