Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TUBA3CQ13748 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TUBA3CQ13748 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TUBA3CQ13748 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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