Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CACNA1SQ13698 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1SQ13698 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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