Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL1Q13616 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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