Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRF5Q13568 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
IRF5Q13568 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms