Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
FOXE3Q13461 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
FOXE3Q13461 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms