Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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SCGB2A2Q13296 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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SCGB2A2Q13296 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SCGB2A2Q13296 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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